消化道的神經支配主要有:
副交感神經興奮時，其末梢釋放乙酰膽堿，與效應器細胞膜上的M受體結合，能促進胃腸運動，使其緊張性增強，蠕動加快，括約肌舒張，加快胃腸道內容物的推進速度;能使消化腺的分泌增加，如引起唾液、胃液、胰液和膽汁的分泌;還可使膽囊收縮，奧迪括約肌舒張，膽汁排出量增加。交感神經興奮時，其末梢釋放去甲腎上腺素與效應器細胞膜上相應受體結合后，能抑制胃腸運動，使其緊張性降低，蠕動減弱或停止，括約肌收縮，減慢胃腸內容物的推進速度;消化腺分泌減少;還可抑制膽囊的運動，奧迪括約肌收縮，減少膽汁排出。
從食管中段至肛門的消化道管壁內還存在壁內神經叢(包括肌間神經叢和粘膜下神經叢)，食物對消化管的機械或化學刺激，可通過壁內神經叢引起消化管運動和腺體分泌，稱為局部反射或稱壁內神經反射。
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